bioinformatics - 🔬 バイオインフォマティクスの無料の独学教育への道!
(:microscope: Path to a free self-taught education in Bioinformatics!)
オープンソースソサイエティ大学
内容
に関しては
これは、世界で最高の大学のコースで、自分の時間に無料でバイオインフォマティクスコースを修了したい人にとっては確かな道です。
私たちのカリキュラムでは、MOOC(大規模オープンオンラインコース)スタイルのコースは私たちの学習スタイルを念頭に置いて作成されたため、これらのコースを優先しています。
バイオインフォマティシャンになるには、かなり多くの科学を学ぶ必要があるため、次のような科目の準備をしてください。生物学、化学など
動機と準備
ここにあなたの旅にすべての違いを生むことができる2つの興味深いリンクがあります。
1つ目は、コンピュータサイエンスの4年間のMITカリキュラム全体を1年間で学ぶことで構成される「MITチャレンジ」を経験した男を示す動機付けのビデオです。
2番目のリンクは、芸術、音楽、文学、数学、科学、スポーツ、および他の多くの分野の専門家が使用する学習テクニックを教えるMOOCです。これらは私たちの旅で成功するための基本的な能力です。
始める準備はできていますか?
カリキュラム
1年目
| コード | コース | 期間 | 努力 |
|---|---|---|---|
| バイオ1311 | 生物学基礎 | 12週間 | 7-14時間/週 |
| 化学1311 | 化学科学の原理 | 15週間 | 週4-6時間 |
| Py4E | みんなのためのパイソン | 10週間 | 10時間/週 |
| 6.00.1倍 | Pythonを使用したコンピュータサイエンスとプログラミング入門(alt) | 9週間 | 15時間/週 |
| 数学1311 | 大学の代数と問題解決 | 4週間 | 6時間/週 |
| 数学1312 | 微積分前 | 4週間 | 6時間/週 |
| 18.01.1倍 | 微積分1A:微分 | 13週間 | 6-10時間/週 |
| 18.01.2倍 | 微積分1B:積分 | 13週間 | 週5-10時間 |
| 数学1315 | 確率とデータ入門 (R を使用) | 5週間 | 6時間/週 |
2年目
| コード | コース | 期間 | 努力 |
|---|---|---|---|
| バイオ2311 | 生化学 | 15週間 | 4-6時間/週 |
| 化学2311 | 有機化学 | 15週間 | 4-6時間/週 |
| コンプ 2311 | CS 2 - オブジェクト指向Java | 6週間 | 4-6時間/週 |
| 18.01.3倍 | 微積分1C:座標系と無限級数 | 6週間 | 5-10時間/週 |
| 6.042円 | コンピュータサイエンスのための数学(ソリューション) | 13週間 | 5時間/週 |
| コンプ 2312 | データベース | 10週間 | 8-12時間/週 |
| 18.06 | 線形代数と線形代数の本質 | 14週間 | 12時間/週 |
| コンプ 2313 | リナックス入門 | 8週間 | 5-7時間/週 |
| 数学2314 | 推論統計 (R を使用) | 5週間 | 6時間/週 |
3年目
| コード | コース | 期間 | 努力 |
|---|---|---|---|
| バイオ3311 | タンパク質の生物学 | 5週間 | 4-6時間/週 |
| コンプ 3311a | アルゴリズム的思考1 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 3311b | アルゴリズミック思考2 | 4週間 | 6時間/週 |
| 数学3311 | 線形回帰とモデリング (R を使用) | 4週間 | 6時間/週 |
| 数学3312 | ベイズ統計 (R を使用) | 5週間 | 6時間/週 |
| バイオ3312 | 細胞生物学 | -週間 | - 時間/週 |
| 数学3313 | 微分方程式 | 7週間 | 8-10時間/週 |
| バイオ3313a | 生物統計学1 | 4週間 | 3-5時間/週 |
| バイオ3313b | 生物統計学2 | 4週間 | 3-5時間/週 |
4年目
| コード | コース | 期間 | 努力 |
|---|---|---|---|
| バイオ4311 | DNA:生物学の遺伝暗号 | 6週間 | 4-6時間/週 |
| コンプ 4311 | データサイエンス | 13週間 | 10時間/週 |
| バイオ4312a | 分子生物学 | 16週間 | 4-8時間/週 |
| バイオ4312d | バイオインフォマティクス1 | 4週間 | 4-10時間/週 |
| コンプ 4312a | バイオインフォマティクス2 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 4312b | バイオインフォマティクス3 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 4312c | バイオインフォマティクス4 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 4312d | バイオインフォマティクス5 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 4312e | バイオインフォマティクス6 | 4週間 | 6時間/週 |
| コンプ 4312f | バイオインフォマティクス7(キャップストーン) | 3週間 | 3-4時間/週 |
| バイオ4313 | 進化 | 11週間 | 4-6時間/週 |
追加年
| コード | コース | 期間 | 努力 |
|---|---|---|---|
| コンプ 5311 | 機械学習の概要 | 10週間 | 6時間/週 |
| コンプ 5312 | ディープラーニング | 8週間 | 6時間/週 |
| 延長 | ゲノムデータサイエンススペシャライゼーション | 32週間 | 6時間/週 |
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このガイドの使用方法
クラスの順序
このガイドは、線形アプローチで使用するために開発されました。これはどういう意味ですか?一度に1つのコースを完了する必要があります。
コースはすでに完了する必要がある順序になっています。最初のコース「生物学入門」を開始し、それが終わったら、次のコースを開始します。
コースが開いていない場合は、アーカイブされたリソースを使用するか、次のクラスが開くまで待ちます。
進捗状況を追跡して表示する方法
- Trello でアカウントを作成します。
- このボードを個人アカウントにコピーします。ボードをコピーする方法については、こちらをご覧ください。
公式ボードのコピーができたので、学習を進めながらカードを列または列に渡すだけです。
Doing
Done
また、プロセスをより細かく制御するのに役立つラベルもあります。これらの各ラベルの意味は次のとおりです。
-
Main Curriculum
:そのラベルの付いたカードは、カリキュラムにリストされているコースを表します。 -
Extra Courses
: そのラベルの付いたカードは、学生が追加したコースを表します。 -
Doing
:そのラベルの付いたカードは、学生が現在行っているコースを表します。 -
Done
: そのラベルの付いたカードは、学生が終了したコースを表します。これらのカードには、そのようなコースで習得した知識で構築された少なくとも1つのプロジェクト/記事へのリンクも必要です。 -
Section
:そのラベルの付いたカードは、カリキュラムにあるセクションを表しています。ラベルの付いたカードは、[完了] 列の整理を支援するためだけのものです。コースのカードは、それぞれのセクションのカードの下に配置する必要があります。Section
-
Extra Sections
:そのラベルの付いたカードは、学生が追加したセクションを表します。
このボードの目的は、生徒に進捗状況を追跡する方法と、友人、家族、雇用主などの公開ページを通じて進捗状況を示す機能を提供することです。ボードのステータスをパブリックまたはプライベートに変更できます。
すべてのコースを受講する必要がありますか?
はい！意図は、ここにリストされているすべてのコースを終了することです!また、コースワークが終わった後、論文を読んだり、研究プロジェクトに参加したりして、さらに多くのことを完了することを強くお勧めします。
コース期間
通常のバイオインフォマティクスコースと比較して、すべてのクラスを完了するのに時間がかかる場合がありますが、報酬がモチベーション/献身に比例することを保証できます。
あなたはあなたの習慣に集中し、目標を忘れなければなりません。このカリキュラムを毎日1~2時間かけて勉強してみてください。これを行うと、必然的にこのカリキュラムを修了します。
「目標ではなくプロセスにコミットする」の詳細については、こちらをご覧ください。
プロジェクトベース
ここOSS大学では、実際のプロジェクトに焦点を当てているため、試験を受ける必要はありません。
コースを無事に修了したことを全員に示すには、実際のプロジェクトを作成するか、論文を書いて、バイオインフォマティクスに焦点を当てたことについて公開する必要があります。
「どういう意味ですか?」
コースを修了したら、コースで習得した知識を使用して解決できる現実世界の問題について考える必要があります。大きなプロジェクトを作成する必要はありませんが、知識を検証して統合し、学んだ概念で役立つものを作成できることを世界に示すために、何かを作成する必要があります。
OSSU-バイオインフォマティクスバッジをリポジトリのREADMEに入れてください!
- 値下げ：
[](https://github.com/open-source-society/bioinformatics)
- .HTML：
<a href="https://github.com/open-source-society/bioinformatics"><img alt="Open Source Society University - Bioinformatics" src="https://img.shields.io/badge/OSSU-bioinformatics-blue.svg"></a>
このプロジェクトは、単独で作成することも、他の学生と一緒に作成することもできます。
創造的になりましょう!
これは、これらすべてのコースを旅する上で重要な部分です。
学んだ概念で作成できるものが証明書であり、これが本当に重要であることを覚えておく必要があります。
あなたが本当にそれらのことを学んだことを示すために、あなたは創造的である必要があります!
これを行う方法に関するヒントを次に示します。
- 記事:ブログ投稿を作成して、学んだことを統合/要約します。
- GitHubリポジトリ:コースのファイルをGHリポジトリに整理して、他の学生がそれを使用して注釈を学習できるようにします。
共同作業
私たちは共同作業が大好きです!私たちのチャンネルを使用して他のフェローとコミュニケーションを取り、新しいプロジェクトを組み合わせて作成してください!
どのプログラミング言語を使用すればよいですか?
スキルのリスト:
- C/C++
- Unix システム
- Python/Perl
- R
- アルゴリズム
上記のスキルは、バイオインフォマティシャンおよび計算生物学者が依存する非常に重要なツールセットです。
各コースで重要なことは、コアコンセプトを内面化し、好きなツール(プログラミング言語)で使用できるようにすることです。
コンテンツポリシー
共有できるのは許可されているファイルのみである必要があります。一部のコースの最初に署名した行動規範を軽視しないでください。
あなたの進歩を示すために創造的になりましょう!
Stay tuned
Watch this repository for futures improvements and general information.
Prerequisite
Students without a strong high school background in Biology will benefit from Getting up to Speed in Biology.
Understanding how to use Git to version your work can be hugely beneficial and is generally not taught in other courses. Version Control with Git should get you up to speed.
How to collaborate
You can open an issue and give us your suggestions as to how we can improve this guide, or what we can do to improve the learning experience.
You can also fork this project and send a pull request to fix any mistakes that you have found.
TODO: If you want to suggest a new resource, send a pull request adding such resource to the extras section.
エクストラセクションは、私たち全員が興味深い追加の記事、本、コース、専門分野を提出できる場所であり、カリキュラムを可能な限り不変かつ簡潔に保ちます。
一緒にやりましょう!=)
行動規範
コミュニティ
私たちは不和サーバーを持っています!これは、他のOSSUの学生と話すための最初の停留所である必要があります。今すぐ自己紹介をしてみませんか?
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また、GitHub の問題を通じて対話することもできます。
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チーム
- カリキュラム創設者:エネス・ケマル・エルギン
- カリキュラムメンテナ:エネスケマルエルギン
- 寄稿者: 寄稿者
